Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcc4E9Q236 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc4E9Q236 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms