Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Myo5cE9Q1F5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Myo5cE9Q1F5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Myo5cE9Q1F5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms