Protein–RNA interactions for Protein: E9Q048

Ermard, ER membrane-associated RNA degradation, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErmardE9Q048 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ErmardE9Q048 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ErmardE9Q048 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ErmardE9Q048 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ErmardE9Q048 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ErmardE9Q048 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ErmardE9Q048 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ErmardE9Q048 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ErmardE9Q048 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms