Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddx60E9PZQ1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ddx60E9PZQ1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ddx60E9PZQ1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ddx60E9PZQ1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ddx60E9PZQ1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ddx60E9PZQ1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx60E9PZQ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx60E9PZQ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx60E9PZQ1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx60E9PZQ1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx60E9PZQ1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx60E9PZQ1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddx60E9PZQ1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddx60E9PZQ1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddx60E9PZQ1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx60E9PZQ1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx60E9PZQ1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx60E9PZQ1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx60E9PZQ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx60E9PZQ1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
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