Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Syde2E9PUP1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Syde2E9PUP1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms