Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca3bE9PUL3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca3bE9PUL3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clca3bE9PUL3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms