Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1110002E22RikE0CYV9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1110002E22RikE0CYV9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms