Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.31■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4930558K02RikE0CXC6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930558K02RikE0CXC6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms