Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ldlrad1D3YYZ1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ldlrad1D3YYZ1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ldlrad1D3YYZ1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms