Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mterf1bB9EJ57 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mterf1bB9EJ57 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms