Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ppfia1B2RXQ2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfia1B2RXQ2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms