Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rd3lB2RV38 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rd3lB2RV38 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms