Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zscan5bB2RTN3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan5bB2RTN3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms