Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brpf1B2RRD7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brpf1B2RRD7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.6 ms