Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ythdc2B2RR83 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ythdc2B2RR83 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ythdc2B2RR83 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ythdc2B2RR83 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Ythdc2B2RR83 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ythdc2B2RR83 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ythdc2B2RR83 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ythdc2B2RR83 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ythdc2B2RR83 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ythdc2B2RR83 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ythdc2B2RR83 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ythdc2B2RR83 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ythdc2B2RR83 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ythdc2B2RR83 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ythdc2B2RR83 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ythdc2B2RR83 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ythdc2B2RR83 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ythdc2B2RR83 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ythdc2B2RR83 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ythdc2B2RR83 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ythdc2B2RR83 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ythdc2B2RR83 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Ythdc2B2RR83 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms