Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Zbed5B2RPU8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Zbed5B2RPU8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zbed5B2RPU8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms