Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn8B1ARD8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slfn8B1ARD8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms