Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
4931406B18RikA2RSL7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
4931406B18RikA2RSL7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931406B18RikA2RSL7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms