Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xlr4aA2BI40 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Xlr4aA2BI40 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms