Protein–RNA interactions for Protein: A2AJT4

Pnisr, Arginine/serine-rich protein PNISR, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnisrA2AJT4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PnisrA2AJT4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PnisrA2AJT4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PnisrA2AJT4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PnisrA2AJT4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms