Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prdm12A2AJ77 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdm12A2AJ77 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm12A2AJ77 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms