Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbbp8nlA2ABX0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rbbp8nlA2ABX0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rbbp8nlA2ABX0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms