Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itgb4A2A863 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Itgb4A2A863 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itgb4A2A863 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms