Protein–RNA interactions for Protein: A2A825

Rsg1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsg1A2A825 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsg1A2A825 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsg1A2A825 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsg1A2A825 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsg1A2A825 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsg1A2A825 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsg1A2A825 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsg1A2A825 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rsg1A2A825 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsg1A2A825 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsg1A2A825 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms