Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm6268A2A3U9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm6268A2A3U9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm6268A2A3U9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm6268A2A3U9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms