Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp1bA1Z198 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp1bA1Z198 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrp1bA1Z198 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms