Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc173A0JLY1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc173A0JLY1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc173A0JLY1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.3 ms