Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930469K13RikA0A286YDB2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms