Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms