Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv26A0A0B4J1P5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv26A0A0B4J1P5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv26A0A0B4J1P5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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