Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Trbv21A0A0A6YX06 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trbv21A0A0A6YX06 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trbv21A0A0A6YX06 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trbv21A0A0A6YX06 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Trbv21A0A0A6YX06 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trbv21A0A0A6YX06 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Trbv21A0A0A6YX06 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Trbv21A0A0A6YX06 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Trbv21A0A0A6YX06 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Trbv21A0A0A6YX06 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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