Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Trbv21A0A0A6YX06 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trbv21A0A0A6YX06 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trbv21A0A0A6YX06 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Trbv21A0A0A6YX06 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Trbv21A0A0A6YX06 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Trbv21A0A0A6YX06 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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