Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPJ1

1700017N19Rik, RIKEN cDNA 1700017N19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700017N19RikA0A087WPJ1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
1700017N19RikA0A087WPJ1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
1700017N19RikA0A087WPJ1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700017N19RikA0A087WPJ1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms