Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms