Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Pfdn5Q9WU28 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pfdn5Q9WU28 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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