Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms