Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms