Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pop5Q9DB28 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms