Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CWU4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CWU4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms