Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms