Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smurf1Q9CUN6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms