Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ykt6Q9CQW1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms