Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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