Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms