Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rhbdd2Q8VEK2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms