Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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