Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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