Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms