Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms