Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Ercc8Q8CFD5 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Ercc8Q8CFD5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Ercc8Q8CFD5 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Ercc8Q8CFD5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Ercc8Q8CFD5 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Ercc8Q8CFD5 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Ercc8Q8CFD5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Ercc8Q8CFD5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Ercc8Q8CFD5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Ercc8Q8CFD5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Ercc8Q8CFD5 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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