Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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